Szkoła powstała w 1834 roku. Założył ją hrabia Julian v. Dąmbski, ówczesny właściciel Kościelca.

Jak czytamy w opracowaniu Róży Sieleckiej "Szkoła Podstawowa w Kościelcu Kujawskim w latach 1990-1998 . Studium historyczno pedagogiczne", do 1885 roku nauczaniem dzieci zajmował się organista parafii pw. św. Małgorzaty w Kościelcu. W 1837 roku poświęcono nowo postawiony budynek szkolny. Uczyły się tutaj dzieci z terenu obejmującego ówczesne dobra Kościelca z folwarkami: Dziarnowo, Leszczyce, Rycerzewko, a także Rycerzewo, Mimowola, Odmianowo i Gorzany. W 1850 roku uczyło się tu 75 dzieci, a w 1900 - aż 248. Dlatego też postawiono nowy budynek z czterema klasami. Szkołę rozbudowano w latach 60. XX wieku. W sprawę mocno zaangażowali się rodzice, którzy na ten cel opodatkowali się płacąc po 100 zł.

Szkoła ma bardzo bogatą historię. Na wyróżnienie zasługuje rok 1906, gdy uczniowie ogłosili strajk. Nie chcieli posługiwać się językiem niemieckim. Warto podkreślić również, że to do tej szkoły w latach 1935-1939 oraz w roku 1945 uczęszczał ksiądz kardynał Józef Glemp.