Makaron pełnoziarnisty nie jest polecany osobom, które walczą ze stanami zapalnymi jelit,

Makaronu pełnoziarnistego powinny unikać też osoby zmagające się ze zgagą

Pełnoziarnisty makaron nie jest polecany także osobom z wrzodami żołądka lub dwunastnicy z uwagi na zawartość błonnika

Makaron nie powinien również stanowić elementu diety u osób, które chorują na celiakię