Modyfikacje pojawiły się także w dużym bloku zatytułowanym „Opór”. Dotychczas opowieść muzealna w tej części rozpoczynała się od Sophie Scholl, niemieckiej działaczki antynazistowskiego ruchu oporu, straconej w 1943 r. Scholl pozostała, ale obecnie na pierwszym planie w „Oporze” spotykamy legendę polskiej partyzantki, mjr. Jana Piwnika „Ponurego”, Cichociemnego.

Dla Mariana Rejewskiego również zostało wydzielone osobne miejsce. Stanowi teraz centralną postać opowieści o łamaniu niemieckich szyfrów. Jest pokazany tak, jak na to zasługuje, to znaczy na miarę swojego wielkiego dokonania!