Urodził się w Toruniu, a od 1973 roku mieszkał w Bydgoszczy. Jak mówił, zawsze chciał zostać reżyserem, a do radia trafił przez przypadek. Michał Jagodziński ukończył filologię polską na Uniwersytecie Mikołaja Kopernika w Toruniu i Szkoły Głównej Handlowej w Warszawie.
W latach 90. był dyrektorem Pomorskiej Rozgłośni Polskiego Radia. Od 1 grudnia 1993 do roku 2000 i od 2006 do 2015 pełnił funkcję Prezesa Zarządu Polskiego Radia PiK. Na stanowisku zastąpił go Cezary Wojtczak.
Tworzył audycje artystyczne i wielokrotnie nagradzane reportaże.